해양 및 호수의 수질은 최근 들어, 여러 가지 형태의 환경오염으로 점차 부영양화 되어가고 있다. 부영양화된 수계에서 흔히 나타나는 대표적 현상으로서는 적조, 녹조 및 유해식물플랑크톤의 대량증식에 수자원의 오염과 독화 현상같은 수서생태계의 교란현상이 발생한다.

적조 및 녹조가 발생된 수역은 폭발적으로 증가된 식물플랑크톤이 영양염의 고갈로 사멸함에 따라 무산소수괴가 형성되어 각종 수서생물의 폐사를 유발시킨다. 또 몇몇 독성플랑크톤은 강력한 독을 생산하여, 물고기를 폐사시키고 이매패류를 독화시켜 인간의 중독사 뿐만아니라 수산자원의 독화에 큰 영향을 미친다.

이외에도 도시 및 산업폐수로 부터의 오염물질의 부하는 중금속 및 유독물질이 수서생물의 체내에 축적되거나 증폭되는 현상을 초래하여 유용수산생물자원의 이용을 불가능하게하여 수산경제의 침체와 국민 식품위생에 큰 영향을 미치고 있다.

본 연구실에서는 호소 및 해양의 기초생산자로서 환경의 변화에 가장 민감한 식물플랑크톤을 대상으로 생활사, 광합성율, 영양요구특성, 분자계통분류, 생리생태, 분자생태학적 특성 등의 연구를 통한 환경오염에 따른 생물의 반응과 적응기작 및 해양 및 호소의 생태계 기능을 규명함으로서
적조 및 녹조의 생물학적 제어기술 유해조류 (HABs)의 발생예측과 모니터링을 위한 DNA-probe 개발, 지구온난화 방지를 위한 CO2 저감기술개발 등의 생태기술 개발을 통하여 수권생태계 자원 및 수환경의 보존과 보호 그리고 복원을 위한 환경생태학적인 연구를 집중적으로 다루고 있다.